Декан факультета политических наук в Европейском университете Петербурга, Григорий Голосов, объявил о закрытии данной программы. Он отметил, что администрация университета не делала официального заявления об этом. Последние выпускники факультета уже получили дипломы, а студенты, перешедшие на второй курс магистратуры и аспирантуры, будут завершать обучение на программе, которая теперь входит в состав Факультета истории. Сам профессор уходит в продолжительный отпуск.
В мае 2023 года Русская служба «Би-би-си» сообщила, что прокуратура и Рособрнадзор проводят проверку университета на предмет экстремизма. В декабре университет был оштрафован на 70 тысяч рублей за участие в деятельности «нежелательной» организации, согласно статье 20.33 КоАП. Причиной выписки штрафов послужили книги, найденные в библиотеке университета.
Ректор университета Вадим Волков рассказал РБК 24 июня, что ведомства также проверили 98 программ университета и 12 магистерских диссертаций. Он отметил, что большинство замечаний касались недооценки вклада российских мыслителей, прозападной ориентации, проявления буржуазной ментальности и других недостатков. Также были выявлены случаи негативного воспитательного воздействия или критического отношения к современной российской политике в нескольких выпускных работах.
В ответ на замечания, преподаватели университета учли замечания, внесли изменения в программы и процесс научного руководства. Надеются, что данные шаги помогут университету устранить выявленные проблемы и продолжить свою деятельность в соответствии с требованиями и стандартами.